阿里巴巴的股东由云锋基金、中投公司、新加坡淡马锡公司等机构组成，其中，日本软银集团持有的股份最多，为34.4%，雅虎集团持有的股份为约22%，而马云只持有约8%的股份。

一、阿里巴巴股权结构

在2014年阿里巴巴的IPO文件中透露，日本软银集团持股797,742,980股，占比34.4%，为最大股东；雅虎持股523,565,416股，占比22.6%，为第二大股东；阿里巴巴董事局主席马云持有206,100,673股，占比8.9%，为最大个人股东；阿里巴巴联合创始人蔡崇信持有83,499,896股，占比3.6%。

在软银、雅虎、马云、蔡崇信之外的最大股东是Fengmao Investment Corporation，它持有66,451,613股，占比2.8 %；Silver Lake affiliated entities持有阿里巴巴集团58,929,509股普通股，占比2.5%；云峰基金（Yunfeng affiliated entities）共持有34,814,817股，占比1.5%；中信（CITIC Capital Excel Wisdom Fund, L.P）持有25,806,451股，占比1.1%；Broad Sino Developments Limited持有10,967,742，占比0.5%；Prosperous Wintersweet (BVI) Limited持有10,516,129股，占比0.5%；Ever Green Growth Limited持有2,258,064股，占比0.1%；Asia Alternatives Management LLC持有1,935,484股，占比0.1%；Pavilion Capital Fund Holdings Pte.Ltd.持有1,935,484股，占比0.1%；Li Ka Shing (加拿大) Foundation持有1,290,323股，占比0.1%。

截至2017年6月9日，软银集团持有阿里巴巴29.2%的股权，为阿里的第一大股东，雅虎持有阿里巴巴15%的股权，为第二大股东，马云持有阿里巴巴7%的股权，为最大个人股东，阿里巴巴集团董事局执行副主席蔡崇信持有约2.5%的股权，仅次于马云。

二、持股变动

2014至2017三年中，雅虎的股权下降了7.6%，变化最大。就在2017年6月，雅虎公司宣布已将核心业务出售给通信企业韦里孙，而原雅虎最为值钱的部分，包括阿里集团的股权等在内的资产则归属为新建的Altaba公司。而软银公司也曾由于负债等问题减持阿里股票，2016年6月抛售价值89亿美元的股票。这项交易是软银投资阿里巴巴以来，首次宣布出售后者股份。对于软银选择在此时出售部分股份，美国《华尔街日报》援引消息人士的话说，阿里巴巴表示理解其动机。阿里巴巴预期双方关系来日方长。软银强调，鉴于孙正义依然未离开阿里巴巴董事会，马云也仍在软银董事会，双方将保持“牢固关系”。

马云去年同期持有约7.8%的阿里股票，2016年8月，马云宣布将在未来一年内减持990万股阿里巴巴股票，套现60亿元左右，主要用于履行公益捐款的承诺及更好地管理财富。2017年1月，蔡崇信也以同样的理由出售阿里约650万股股份。